武汉病毒所在全球虫媒病毒与节肢动物特异性病毒序列、多样性、生物安全风险综合数据集方面获进展|世界看点

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日期:2023-05-23 15:36:56    来源:武汉病毒研究所    


(资料图)

吸血节肢动物中传播循环的病毒有两大类,即虫媒病毒(arbovirus)和节肢动物特异性病毒(arthropod-specific virus,ASV)。虫媒病毒能在脊椎动物和节肢动物中复制,对人类或动物具有致病性,给全球公共卫生造成负担。节肢动物特异性病毒仅在节肢动物中复制,可能是虫化病毒进化的起源。然而,目前没有涵盖所有已知虫媒病毒和节肢动物特异病毒种类、生物安全风险等级、基因组节段、地理分布等信息的综合数据集。

5月19日,《科学数据》(Scientific Data)在线发表了中国科学院武汉病毒研究所/生物安全大科学中心袁志明/夏菡团队在虫媒病毒生态健康和生物安全领域的最新研究成果(《全球虫媒病毒和节肢动物特异病毒的序列、多样性及生物安全风险综合数据集》,A global dataset of sequence, diversity and biosafety recommendation of arbovirus and arthropod-specific virus)。该研究通过整合美国CDC虫媒病毒名录(Arbovirus Catalog)、第六版《微生物和生物医学实验室生物安全》(BMBL 6th)附录VIII-F、国际病毒分类委员会(ICTV)的病毒分类信息以及Genbank序列等相关信息,提取分类学、生物安全风险、基因节段、核酸和氨基酸序列、地理分布等信息,构建了首个全球虫媒病毒和节肢动物特异病毒的综合数据集。

该数据集包含615个虫媒病毒(460个病毒种)、98,994条记录和190个节肢动物特异病毒(180个病毒种)、2,100条记录,涉及34个病毒科、89个病毒属和640个病毒种(图1a)。该成果展示了虫媒病毒和节肢动物特异病毒间的基因组节段差异(图1b)、生物安全风险建议等级(图1c)、病毒及其节肢动物媒介的全球分布、宿主来源等特征(图1d)。为剖析虫媒病毒和节肢动物特异病毒的相互作用、进化规律和风险评估提供了丰富的数据资源(图2)。

该研究由武汉病毒所和浙江大学合作完成。研究工作得到国家重点研发计划、国家自然科学基金和中国科学院中-非联合研究中心等的支持。

论文链接

数据链接

图1. 虫媒病毒和节肢动物特异病毒的分类、基因组节段和生物安全分级建议和宿主来源

图2. figshare数据集部分信息

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